| 氏名 | 前職 | 在任 | 退職後の役職 | 備考 |
| 谷口恒二 | 主計局長 | 1941年7月25日 － 1944年3月24日 | 日本銀行副総裁（1945年5月25日の東京大空襲にて戦災死） | |
| 松隈秀雄 | 主税局長 | 1944年3月24日 － 1945年2月23日 | 専売公社総裁 | |
| 田中豊 | 主税局長 | 1945年2月23日 － 1945年4月13日 | 勧銀副総裁･宝酒造社長 | |
| 山際正道 | 総務局長 | 1945年4月13日 － 1946年1月30日 | 輸銀総裁･日銀総裁 | |
| 山田義見 | 印務局長 | 1946年1月30日 － 1947年2月6日 | 勧銀会長･会計検査院長 | |
| 池田勇人 | 主税局長 | 1947年2月6日 － 1948年3月11日 | 衆院議員･内閣総理大臣 | 京大法卒 |
| 野田卯一 | 専売局長官 | 1948年3月11日 － 1949年2月18日 | 専売公社副総裁･参院議員･衆院議員･経企庁長官 | |
| 長沼弘毅 | 管理局長 | 1949年2月18日 － 1951年4月20日 | 公取委員長 | |
| 舟山正吉 | 銀行局長 | 1951年4月20日 － 1953年8月14日 | 中小公庫総裁 | |
| 河野一之 | 主計局長 | 1953年8月14日 － 1955年7月19日 | 太陽銀行頭取･太陽神戸銀行会長 | |
| 平田敬一郎 | 国税庁長官 | 1955年7月19日 － 1957年5月31日 | 開銀総裁･地域振興整備公団総裁 | |
| 森永貞一郎 | 主計局長 | 1957年5月31日 － 1959年6月23日 | 中小公庫総裁･輸銀総裁･東証理事長･日銀総裁 | |
| 石田正 | 銀行局長 | 1959年6月23日 － 1961年5月30日 | 国民公庫総裁･輸銀総裁 | |
| 石原周夫 | 主計局長 | 1961年5月30日 － 1963年4月1日 | 開銀総裁･海外経済協力基金総裁 | |
| 石野信一 | 主計局長 | 1963年4月1日 － 1965年4月23日 | 神戸銀行頭取･太陽神戸銀行頭取 | |
| 佐藤一郎 | 主計局長 | 1965年4月23日 － 1967年1月10日 | 参院議員･経企庁長官･衆院議員 | |
| 谷村裕 | 主計局長 | 1967年1月10日 － 1968年6月7日 | 公取委員長･東証理事長 | |
| 村上孝太郎 | 主計局長 | 1968年6月7日 － 1969年8月6日 | 参院議員 | |
| 澄田智 | 銀行局長 | 1969年8月6日 － 1971年6月11日 | 輸銀総裁･日銀総裁 | |
| 鳩山威一郎 | 主計局長 | 1971年6月11日 － 1972年6月27日 | 参院議員･外相 | |
| 吉國二郎 | 国税庁長官 | 1972年6月27日 － 1973年6月26日 | 横浜銀行頭取 | |
| 相澤英之 | 主計局長 | 1973年6月26日 － 1974年6月26日 | 衆院議員･経企庁長官 | |
| 高木文雄 | 主税局長 | 1974年6月26日 － 1975年7月8日 | 弁護士･国鉄総裁 | |
| 竹内道雄 | 主計局長 | 1975年7月8日 － 1977年6月10日 | 輸銀総裁･東証理事長 | |
| 吉瀬維哉 | 主計局長 | 1977年6月10日 － 1978年6月17日 | 開銀総裁 | |
| 大倉真隆 | 主税局長 | 1978年6月17日 － 1979年7月10日 | 国民公庫総裁･輸銀総裁･横浜銀行頭取 | |
| 長岡實 | 主計局長 | 1979年7月10日 － 1980年6月17日 | 専売公社総裁･東証理事長 | |
| 田中敬 | 主計局長 | 1980年6月17日 － 1981年6月26日 | 国民公庫総裁･輸銀総裁･横浜銀行頭取 | |
| 高橋元 | 主税局長 | 1981年6月26日 － 1982年6月1日 | 国民公庫総裁･開銀総裁 | |
| 松下康雄 | 主計局長 | 1982年6月1日 － 1984年6月27日 | 太陽神戸銀行頭取･さくら銀行会長･日銀総裁 | |
| 山口光秀 | 主計局長 | 1984年6月27日 － 1986年6月10日 | 海外経済協力基金総裁･輸銀総裁･東証理事長 | |
| 吉野良彦 | 主計局長 | 1986年6月10日 － 1988年6月15日 | 国民公庫総裁･開銀総裁 | |
| 西垣昭 | 主計局長 | 1988年6月15日 － 1989年6月23日 | 海外経済協力基金総裁 | |
| 平澤貞昭 | 銀行局長 | 1989年6月23日 － 1990年6月29日 | 国民公庫総裁･横浜銀行頭取 | |
| 小粥正巳 | 主計局長 | 1990年6月29日 － 1991年6月11日 | 公取委員長･日本政策投資銀行総裁 | |
| 保田博 | 主計局長 | 1991年6月11日 － 1992年6月26日 | 輸銀総裁･国際協力銀行総裁 | |
| 尾崎護 | 国税庁長官 | 1992年6月26日 － 1993年6月25日 | 国民公庫総裁 | |
| 斎藤次郎 | 主計局長 | 1993年6月25日 － 1995年5月26日 | 東京金融取引所社長･日本郵政代表執行役社長 | |
| 篠沢恭助 | 主計局長 | 1995年5月26日 － 1996年1月5日 | 国際協力銀行総裁 | |
| 小川是 | 国税庁長官 | 1996年1月5日 － 1997年7月15日 | 日本たばこ産業会長･横浜銀行頭取､会長､全国銀行協会会長 | |
| 小村武 | 主計局長 | 1997年7月15日 － 1998年1月30日 | 日本政策投資銀行総裁 | |
| 田波耕治 | 内閣内政審議室長 | 1998年1月30日 － 1999年7月8日 | 国際協力銀行総裁 | |
| 薄井信明 | 国税庁長官 | 1999年7月8日 － 2000年6月30日 | 国民公庫総裁､株式会社日本総合研究所理事長 | 東大経済卒 |
| 武藤敏郎 | 主計局長 | 2000年6月30日 － 2003年1月14日 | 日銀副総裁､株式会社大和総研理事長 | |
| 林正和 | 主計局長 | 2003年1月14日 － 2004年7月2日 | 日本投資者保護基金理事長･東京証券取引所自主規制法人理事長 | |
| 細川興一 | 主計局長 | 2004年7月2日 － 2006年7月28日 | 新ｴﾈﾙｷﾞｰ財団顧問･日本政策金融公庫副総裁 | |
| 藤井秀人 | 主計局長 | 2006年7月28日 － 2007年7月10日 | 日本政策投資銀行副社長 | 京大法卒 |
| 津田廣喜 | 主計局長 | 2007年7月10日 － 2008年7月4日 | 早稲田大学大学院公共経営研究科教授 | |
| 杉本和行 | 主計局長 | 2008年7月4日 － 2009年7月14日 | 東京大学公共政策大学院教授､みずほ総合研究所理事長 | |
| 丹呉泰健 | 主計局長 | 2009年7月14日 － 2010年7月30日 | 読売新聞ｸﾞﾙｰﾌﾟ本社社外監査役 | |
| 勝栄二郎 | 主計局長 | 2010年7月30日 - | |