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自然学とは?
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中世､ｱﾘｽﾄﾃﾚｽの『自然学』的自然観がｱﾙﾍﾞﾙﾄｩｽ･ﾏｸﾞﾇｽの検証紹介以降にほぼﾄﾞｸﾞﾏ化したｽｺﾗ学の下では､自然哲学は停滞するが､ﾙﾈｻﾝｽ期を経て､ﾍﾞｰｺﾝやﾃﾞｶﾙﾄらによって近代科学的方法が確立されると､哲学的諸問題に対する自然哲学の重要性はさらに増した｡
一方で､それは自然哲学と自然科学とが分離する前触れでもあった｡ﾄﾞｲﾂ観念論における自然哲学は分離しつつあった両者を哲学的原理から統合しようとする試みとして捉えることができる｡
生物学において､この時期に盛んであった比較解剖学が､多くこの流れを受けている｡
ｹﾞｰﾃもこの分野に多くの影響を与えた｡
彼は植物において花弁や顎がいずれも葉の変形であることを見出し､このような変形を変態と呼んで､生物の構造の発展に重要なものと考えた｡
さらに後の研究者はこのような観点から､多様な生物の形態にはその基本となる『型』が存在すると考えた｡
このような考えは例えば相同器官､相似器官といった概念を生み出し､あるいは同一構造の繰り返し構造(体節など)を認めることで動物の体制の理解などを推し進めた｡
しかしそれは往々にして恣意的な想像を広げることとなり､たとえばｻﾝ･ﾃｨﾚｰﾙは節足動物の付属肢と脊椎動物の肋骨を相同とする論を述べた｡
これには実証主義を掲げて比較解剖学を刷新したｷｭﾋﾞｴが強く反対し､大論争の末にｷｭﾋﾞｴが勝ったのは有名である｡
他方､ｷｭﾋﾞｴは実証主義にこだわって思想性を失った結果､天変地異説を唱えてﾗﾏﾙｸの進化論に反対する等､大局的には大きく見誤ったといえる｡
むしろ自然哲学の流れの最後尾に属するﾗﾏﾙｸ（彼は当時から『最後の哲学者』といわれた｡
これには揶揄の意が込められていた）が内容は誤っていたが進化論を創造した点は重要であると八杉竜一は述べている[2]｡
なお､比較解剖学の思想的な流れは19世紀に発生学に受け継がれる｡
発生学の中で比較発生学という流れが起こり､この分野が比較解剖学が生んだ相同性などの考え方の裏付けを作り始める｡
同時にこれらの分野が生んだ進化論が表舞台に出ると､比較発生学はそれを裏付けると同時に､それを適用することで系統論を生み出した｡
その方向の頂点に立つﾍｯｹﾙはこの視点を徹底化することで全動物群の系統を論じることを可能にしたが､その過程で事実の様々な歪曲を行っている｡
これが後の世代から批判されることとなったのは､観念論的解剖学がｷｭﾋﾞｴの餌食になったのの二の舞を演じているように見える｡
ちなみにﾍｯｹﾙが生物学の歴史を論じているものの中で､彼は観念論的解剖学を高く評価するとともにｷｭﾋﾞｴの立場をつまらない､低級なものとこき下ろしている｡
19世紀以降､近代科学の発展や細分化などに伴い､これまで区別が曖昧であった自然科学と自然哲学の両者は完全に分離して考えられるようになった｡
現在では自然科学諸分野の知識を包括的･全体的に捉えた（哲学的）考察に限定して用いられることがあるが､｢自然哲学｣を標榜する哲学者は極めて少ない｡
しかし､これは｢自然哲学｣の消滅や哲学と自然科学とが相反するものであることを示すものではない｡
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