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･数理科学研究科
｢東京大学大学院数理科学研究科｣を参照
･数理科学専攻
･新領域創成科学研究科
｢東京大学大学院新領域創成科学研究科｣を参照
･物質系専攻
･先端ｴﾈﾙｷﾞｰ工学専攻
･複雑理工学専攻
･先端生命科学専攻
･ﾒﾃﾞｨｶﾙｹﾞﾉﾑ専攻
･自然環境学専攻
･環境ｼｽﾃﾑ学専攻
･人間環境学専攻
･社会文化環境学専攻
･国際協力学専攻
･海洋技術環境学専攻
･情報生命科学専攻
･情報理工学系研究科
｢東京大学大学院情報理工学系研究科｣を参照
･ｺﾝﾋﾟｭｰﾀ科学専攻
･数理情報学専攻
･ｼｽﾃﾑ情報学専攻
･電子情報学専攻
･知能機械情報学専攻
･創造情報学専攻
･情報学環･学際情報学府
｢東京大学大学院情報学環･学際情報学府｣および｢東京大学大学院情報学環教育部｣を参照
･情報学環
･学際情報学圏
･社会情報学圏
･学際情報学府
･学際情報学専攻
･公共政策学連携研究部･公共政策学教育部
｢東京大学大学院公共政策学連携研究部･公共政策学教育部｣を参照
･公共政策学専攻（公共政策大学院）（専門職学位課程）
運営管理が､学部及び大学院各研究科によって行われている組織｡
各組織は､教育及び研究課題別に組織されており､学部附属が教育組織及び実習組織､ｾﾝﾀｰが大学院研究科毎の研究室に相当する組織｡
大学共同研究及び研究課題によっては､学外からの利用も可能｡
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東京農業大学
世界最大級の生物学系研究拠点（世田谷､厚木､ｵﾎｰﾂｸｷｬﾝﾊﾟｽ）
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