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･物性物理学専攻
･宇宙理学専攻
･自然史科学専攻
･附属地震火山研究観測ｾﾝﾀｰ
･附属原子核反応ﾃﾞｰﾀ研究開発ｾﾝﾀｰ
･薬学研究院
･農学院･農学研究院（修士課程･博士後期課程）
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･生命科学院･先端生命科学研究院（修士･博士後期課程）
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･教育学院･教育学研究院（修士課程･博士後期課程）
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･附属子ども発達臨床研究ｾﾝﾀｰ
･国際広報ﾒﾃﾞｨｱ･観光学院 ﾒﾃﾞｨｱ･ｺﾐｭﾆｹｰｼｮﾝ研究院（修士課程･博士後期課程）
･国際広報ﾒﾃﾞｨｱ専攻
･観光創造専攻
･保健科学院
･公共政策学教育部･公共政策学連携研究部（公共政策大学院）
･公共政策学専攻
･総合化学院（修士課程･博士後期課程）
･総合化学専攻 短期大学部
･医療技術短期大学部（2006年（平成18年）に廃止） 附属機関
･附置研究所
･低温科学研究所
･電子科学研究所
･遺伝子病制御研究所
･全国共同利用施設
･触媒化学研究ｾﾝﾀｰ
･ｽﾗﾌﾞ研究ｾﾝﾀｰ
･情報基盤ｾﾝﾀｰ
･学内共同教育研究施設等
･ｱｲｿﾄｰﾌﾟ総合ｾﾝﾀｰ
･機器分析ｾﾝﾀｰ
･留学生ｾﾝﾀｰ
･高等教育機能開発総合ｾﾝﾀｰ
･高等法政教育ｾﾝﾀｰ
･総合博物館
･量子集積ｴﾚｸﾄﾛﾆｸｽ研究ｾﾝﾀｰ
･北方生物圏ﾌｨｰﾙﾄﾞ科学ｾﾝﾀｰ
･耕地圏ｽﾃｰｼｮﾝ植物園（北海道大学植物園）
･ｴﾈﾙｷﾞｰ変換ﾏﾃﾘｱﾙ研究ｾﾝﾀｰ
･ﾍﾞﾝﾁｬｰ･ﾋﾞｼﾞﾈｽ･ﾗﾎﾞﾗﾄﾘｰ
･脳科学研究教育ｾﾝﾀｰ
･創成科学共同研究機構
･人獣共通感染症ﾘｻｰﾁｾﾝﾀｰ
･大学文書館
･ｱﾄﾞﾐｯｼｮﾝｾﾝﾀｰ
･ｱｲﾇ･先住民研究ｾﾝﾀｰ
･保健管理ｾﾝﾀｰ
･環境保全ｾﾝﾀｰ
･観光学高等研究ｾﾝﾀｰ
･言語文化部（現：外国語教育ｾﾝﾀｰ）
･附属図書館
･知的財産本部
･科学技術ｺﾐｭﾆｹｰﾀｰ養成ﾕﾆｯﾄ
･病院
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